¯\_(ツ)_/¯
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Boas,
É normal que após remover programas ou ficheiros, o disco possa ficar desfragmentado. 1% não é algo significativo de todo...
Por norma, o recomendado seria desfragmentar o disco mensalmente. Não é necessário andar sempre a desfragmentar somente por 1 ou 2%...
Quanto ao danificar, nos discos normais (leia-se, sem ser um disco SSD), estraga tanto como se estivesse a mover ou criar ficheiros. Ou seja, não é algo que se deva preocupar.
Agora num disco SSD ou numa Pen USB, visto utilizarem memoria flash e esta possuir um numero limitado de leitura/escrita, a desfragmentação em excesso pode reduzir a vida útil dos mesmos...
Cumps