Foi uma boa decisão a de renomear o disco. Serem ambos identificados pela mesma letra iria causar problemas.
Antes de seguir as minhas instruções seguintes por favor volte a colocar a sequência de boot como estava antes de ter tentado resolver o problema sozinho e ligue os dois discos em simultâneo.
A minha recomendação é que instale a versão mais recente do EasyBCD no disco que arranca por defeito (o EasyBCD é gratuito).
Uma vez instalado, vamos a BCD Deployment -> Install the Windows Vista/7 bootloader to the MBR -> Write MBR. Verifique que esta operação foi bem sucedida antes de continuar. Reinicie o computador e verifique se tudo aparenta estar bem.
Agora, adicionamos a opção de ligar o disco secundário no menu Add New Entry -> Operating Systems -> Windows 7. Na opção Drive, escolha a letra associada ao disco secundário, e em Name dê um nome distinto ao nome, para que no passo seguinte consiga distinguir os dois sistemas operativos (Por exemplo, chame "Windows 7 Principal" ao disco que quer que arranque por defeito).
Novamente, verifique que a operação foi concluída com sucesso e reinicie o computador.
Por último iremos corrigir o disco que arranca por defeito. Abrimos novamente o EasyBCD e acedemos ao menu Edit Boot Menu. Deverão estar listados os dois sistemas operativos, e apenas um terá marcado "Default". O sistema operativo com essa opção seleccionada será o que arrancará por defeito. Por esta altura já deverá saber o que fazer...
Falta só mais uma coisa. Em Time out Options, escolha escolha Count Down From e escolha algo como 10 segundos. Se seleccionar Skip the boot menu arrancará automaticamente para o disco pré-definido, e se escolher Wait for user selection o computador esperará até que escolha manualmente uma das opções para carregar o sistema operativo.
Clique em Save Settings para gravar as opções e tudo deverá estar a funcionar como pretende.
Resultado Final:
Opção de arrancar cada um dos sistemas operativos com o que deseja já pré-definido. Se não seleccionar nada, em 10 segundos será escolhido o principal. Os segundos alteram-se em Edit Boot Menu -> Time Out Options -> Count Down From.
Nota importante:
Sempre que realizar operações deste tipo de importância deverá sempre salvaguardar a sua informação caso ocorra algum erro durante a execução do EasyBCD. Caso isso aconteça (extremamente improvável...), ter um DVD com uma distribuição Linux dá jeito