Acho que estás a misturar aí muita coisa. E não, não me parece que seja nada de mal com o sistema em si.
Se instalaste algo, isso é simples: vê se está aberto ou a correr em segundo plano. Se a aplicação ainda estiver instalada, simplesmente desinstala.
Vê no gestor de tarefas se tem algum processo dessa aplicação ou similar.
Se não tiveres nada, e a aplicação tiver sido removida, não é disso.
Agora, da humidade, sinceramente acho que estás a ir para o "pior cenário" quando não existe necessidade disso.
O PC não é feito de papel. Obviamente, tens de ter cuidado com ele, mas também não é algo que vá desintegrar-se à mais pequena coisa. Pelo que referes, é possível que tenhas problemas mais rapidamente com o software do que com hardware - e software é algo que podes sempre corrigir, nem que seja a reinstalar.
Dito isto: não me parece que esse ruído seja qualquer problema de hardware.
Pode ser, efetivamente, de software, se tiveres algo que esteja a usar o som nessa altura por exemplo. ou se tiveres esse programa que referes em segundo plano.
De resto, acho que não precisas de estar a ter tanto cuidado com o PC - ele não vai simplesmente "explodir" 